Molekulinės ekologijos laboratorija

Molekulinės ekologijos laboratorijos (MEL) pagrindinė tyrimo kryptis – vandens, vištinių ir pelkinių paukščių bei kitų sistematinių gyvūnų grupių genetinės įvairovės ir jos formavimąsi įtakojančių veiksnių tyrimai naudojant molekulinius žymenis. Kita tyrimų kryptis - sarkocistų įvairovės, gyvybinių ciklų ir koevoliucijos reiškinio su tarpiniais ir galutiniais šeimininkais tyrimai. Vykdomos temos „Ištirti natūralių sausumos gyvūnų populiacijų ir bendrijų jautrumo, pažeidžiamumo, prisitaikymo ir mikroevoliucijos globalios kaitos ir žmogaus integruoto poveikio sąlygomis dėsningumus ir mechanizmus, inventorizuoti Lietuvos sausumos ekosistemų fauną, įvertinti biologinę įvairovę ir išteklius“ rėmuose laboratorija atlieka užduotį, susijusią su žąsinių, vištinių ir kitų laukinių paukščių rūšių bei populiacijų genetinės įvairovės ir adaptacijos molekulinių-genetinių mechanizmų tyrimais.

Laboratorijoje vykdomi darbai susiję su modelinių paukščių rūšių (didžiųjų ančių, juodųjų strazdų, upinių žuvėdrų, keršulių) genetinės įvairovės tyrimais naudojant baltymų, izofermentų bei DNR molekulinius žymenis, siekiant nustatyti genotipinių pokyčių dėsningumus bei veiksnius, įtakojančius sėslių populiacijų formavimąsi, migruojančių rūšių populiacinę struktūrą bei vertinant populiacijų būklę šalyje bei rūšių paplitimo areale. Vadovaujant prof. habil. dr. A. Sruogai, laboratorijoje tęsiami žąsinių būrio tyrimai, siekiant įvertinti vietinių žąsų – „Skarulių“, „Vištinių“ bei hibridinių veislių genetinę įvairovę, nustatant filogenetinius ryšius su europinėmis žąsų veislėmis bei, pasitelkus mikrosatelitinius žymenis, gvildenami žąsų domestikacijos aspektai. Naudojant molekulinius metodus tęsiami jūrinių ančių, vištinių paukščių genetinės įvairovės tyrimai.

Laboratorija glaudžiai bendradarbiauja su kitais instituto padaliniais, dalyvauja ruošiant Vilniaus universiteto molekulinės biologijos specializacijos bakalaurus bei magistrantus. MEL vykdo bendrus darbus su Paukščių ekologijos, Jūrų ekologijos, P. B. Šivickio parazitologijos bei Entomologijos laboratorijų, Gėlųjų vandenų ekologijos sektoriaus tyrėjais, organizuoja kasmetines ekspedicijas į Klaipėdos, Šilutės rajonus eksperimentinės medžiagos rinkimui, planuoja bei vykdo eksperimentinius darbus, susijusius su parazitų-šeimininkų hostalinio specifiškumo, gyvybinių ciklų tyrimais. Laboratorija bendradarbiauja su Lietuvos Veterinarijos akademijos Gyvulininkystės instituto tyrėjais, Vytauto Didžiojo, Klaipėdos universitetų biologais, palaiko ryšius bei vykdo bendrus projektus su užsienio partneriais Latvijoje, Rusijoje, Ispanijoje, Prancūzijoje, Taivanyje.

Molekulinės ekologijos laboratorija įkurta Populiacinės genetikos laboratorijos bazėje, patvirtinus naująjį pavadinimą 2008 m. vasario 26 d. Tarybos nutarimu Nr. 10. Plačiau...

Dalius Butkauskas, dr. (hb.) – laboratorijos vadovas, vyriausiasis mokslo darbuotojas, tel. (5) 272 92 87, e. p. dalius@ekoi.lt

Įvairaus taksonominio rango gyvūnų genetinės įvairovės bei populiacijų genetinės struktūros tyrimai naudojant molekulinius žymenis

Petras Prakas, dr. - vyresnysis mokslo darbuotojas, tel. (5) 272 92 87, e. p. petrasprakas@yahoo.com

Simona Stropaitytė - inžinierė

Valentinas Pabrinkis - biologas

Neringa Baniūnė - vyresnioji laborantė

Adomas Ragauskas - doktorantas, tel. (5) 272 92 87, e. p. adomas.ragauskas@yahoo.com

Paslaugos

Projektai

Laukiniai karveliai-keršuliai (Columba palumbus). Atsakingi vykdytojai prof. habil. dr. A. Sruoga, dr.D. Butkauskas. Užsakovas International Wildlife Investigation Group (Prancūzija, Ispanija, Lietuva) (2001-2002)

Sterna genties žuvėdrų, perinčių Nemuno ir Dauguvos baseine, populiacinių ypatybių, genetinės įvairovės bei juos įtakojančių faktorių įvertinimas. Atsakingi vykdytojai prof. habil. dr. A. Sruoga, dr.D. Butkauskas.Užsakovas Lietuvos valstybinis mokslo ir studijų fondas (2002-2004)

Modelinių paukščių rūšių lyginamoji ekologinė ir genetinė analizė. Atsakingas vykdytojas prof. habil. dr. A. Sruoga. Užsakovas Oiseaux Migrateurs du Palearetique Occidental, Prancūzija, Atstovas Lietuvoje OMPO (2004-2005)

Genetinių ir mikrocheminių žymenų panaudojimas migruojančių, saugotinų žuvų rūšių ir populiacijų skaitlingumo reguliavime. Atsakingas vykdytojas prof. habil. dr. A. Sruoga. Užsakovas Mokslinio bendradarbiavimo tarp Lietuvos respublikos švietimo ir mokslo ministerijos, Taivano nacionalinės mokslo tarybos ir Latvijos respublikos švietimo ir mokslo ministerijos paramos fondas (2004-2007)

Publikacijos

Butkauskas, D., Sruoga, A. 2004. Effect of lead and chromium on reproductive success of Japanese quail. Environmental Toxicology 19(4): 412–415.

Švažas, S., Sruoga, A., Paulauskas, A., Butkauskas, D. 2005. Population Structure Among Breeding and Wintering Long-tailed Ducks in the Western Palearctic. Ornis Svecica 15: 206-211.

Kutkienė, L., Sruoga, A. and Butkauskas, D. 2006. Sarcocystis sp. from white-fronted goose (Anser albifrons): cyst morphology and life cycle studies. Parasitology Research 99 (5): 562–565.

Skrodenytė-Arbačiauskienė, V., Sruoga, A. and Butkauskas, D. 2006. Assessment of microbial diversity in the river trout Salmo trutta fario L. intestinal tract identified by partial 16S rRNA gene sequence analysis. Fisheries Science 72 (3): 597–602.

Butkauskas, D., Sruoga, A., Tubelytė-Kirdienė, V., Mozalienė, E. and Paulauskas, A. 2006. Enzyme polymorphism in two Japanese Quail (Coturnix coturnix japonica) lines with different concentrations of plasma lactate. Acta Zoologica Lituanica 16 (3): 177–184.

Sruoga, A., Butkauskas, D., Prakas, P. and Paulauskas, A. 2006. Evaluation of the genetic structure of the breeding Common Tern (Sterna hirundo) population by means of microsatellite markers. Biologija 1: 47–52.

Butkauskas, D., Sruoga, A., Kutkienė, L. and Prakas, P. 2007. Investigation of the phylogenetic relationships of Sarcocystis spp. from Greylag (Anser anser) and White -fronted (Anser albifrons) geese to other cyst forming coccidia using 18S and 28S rRNA gene sequences. Acta Zoologica Lituanica 17 (2): 124–128.

Sruoga, A., Butkauskas, D., Ragauskas, A. and Ložys, L. 2007. Investigation of genetic variability in the European eel (Anguilla anguilla (L.)) in Lithuania using microsatellite DNA markers. Acta Zoologica Lituanica 17 (2): 116–123.

Sruoga, A., Rashal, I., Butkauskas, D. and Ložys, L. 2007. Variety of mtDNA haplotypes in the populations of the European perch (Perca fluviatilis) of the Curonian lagoon, the coastal zone of the Baltic Sea and the Gulf of Riga. Proceedings of the Latvian Academy of Sciences. Section B 61 (3/4) (650/651): 91–95.

Kutkienė, L., Sruoga, A. and Butkauskas, D. 2008. Sarcocystis sp. from the Goldeneye (Bucephala clangula) and the Mallard (Anas platyrhynchos): cyst morphology and ribosomal DNA analysis. Parasitology Research 102 (4): 691–696.

Skrodenytė-Arbačiauskienė, V., Sruoga, A., Butkauskas, D. and Skrupskelis, K. 2008. Phylogenetic analysis of intestinal bacteria of freshwater salmon Salmo salar and sea trout Salmo trutta trutta and diet. Fisheries science 74: 1307–1314.

Butkauskas, D., Švažas, S., Sruoga, A., Bea, A. and Grishanov, G. 2008. Variability of haplotypes among different populations of Woodpigeon (Columba palumbus) in southern Europe and in the eastern Baltic region. Acta Zoologica Lituanica 18 (2): 77–82.

Sruoga, A., Butkauskas, D., Rashal, I. 2008. Evaluation of genetic diversity of perch (Perca fluviatilis) and pikeperch (Sander lucioperca) populations from Curonian Lagoon and inshore waters of the Baltic Sea. Acta Biologica Universitatis Daugavpils 8: 81-88.

Kutkienė, L., Prakas, P., Sruoga, A. and Butkauskas, D. 2009. Sarcocystis in the birds family Corvidae with description of Sarcocystis cornixi sp. nov. from the hooded crow (Corvus cornix). Parasitology Research (2):329-336.

Sruoga, A.; Rashal, I.; Butkauskas, D.; Viksne, J.; Žalakevičius, M.; Švažas, S.; Kaminskaitė, M. 2009. Haplotypic variability and population genetic structure of Garganey and Common Pochard in the Western Palearctic. // Proceedings of the Latvian Academy of Sciences 63(3): 104-110.

Butkauskas, D., Ragauskas, A., Sruoga, A., Ložys, L., Tzeng, W.N. 2009. Current knowledge about European eel Anguilla anguilla (L.) mtDNA D-Loop region haplotypic variety. Acta Zoologica Lituanica. 19(4): 253-267.